Models
- monad ID
- Sequence
- Length
- Target
- Structure String
- Secondary Structure
- Tertiary Structure
- CAGGCUACGCGUAGAGCAUCAUGAUCCUG
- 29
- ....(((....)))...............
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- CGGAAUCAGUGAAUGCUUAUACAUCCG
- 27
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- CGCCGCGGUCUCAGGCGCUGAGUCUGAGUUUACCUGCG
- 38
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- GGGUCCUGCUGCGUAGUUUCCGUCUGCGUGGCUGUUACCC
- 40
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- AAUGAGUGGUUUAUUCGUU
- 19
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- GGCGUAGGAUGCUUCGGCAGAAGGACACGCC
- 31
-
Flavin mononucleotide
- (((((.(..(.((((....)))).)))))))
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- (((((....(((....))).......)))))
- GGGAAGGGAAGAAACUGCGGCUUCGGCCGGCUUCCC
- 36
-
ATP
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- .....((((((...(..((((....)))))))))))
- GGCUGGACUCGUACUUCGGUACUGGAGAAACAGCC
- 35
-
HIV-1 Rev peptide
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- GGACUGGGCGAGAAGUUUAGUCC
- 23
-
Neomycin B
- (((((((((.....)))))))))
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- GGGCGCCGGUACGCAAGUACGACGGUACGCUCC
- 33
-
HTLV-1 Rex peptide
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- GGGAGCUUGAUCCCGGAAACGGUCGAUCGCUCCC
- 34
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- CGAAACAUAGAUUCGA
- 16
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- GGAGAUCGCACUCCA
- 15
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- GGGACGAAGUGGUUGGGCGCUUCGGCGUGUGAAAACGUCCC
- 41
-
GTP
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- GGCAGCCACAAGAGCACGUAUACGCAAGGCUGUC
- 34
-
GTP
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- GAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUC
- 29
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- GGGAUGCUCAGUGAUCCUUCGGGAUAUCAGGGCAUCCC
- 38
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- ACAGCACUGAUUGCGGUCGAGGUAGCUUGAUGG
- 33
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- CCAUACGGGAGAGAAACU
- 18
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- GCACGUCCCUCACCGGUGCAAGUGAAGCCGUGGCUCUGCG
- 40
- (((.(.....((.((((.........))))))...)))).
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- GAUCCUGAAACUGUUUUAAGGUUGGCCGAUC
- 31
- ((((....((((.......))))....))))
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- GGCUUUCGGGCUUUCAACAUCAGCCCCUCAGCC
- 33
-
PC-3
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- GGGGAGGCUGUGGUUGAGGG
- 20
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- GGCGAACAGGGGACGAGCAAGACGCC
- 26
- ((((....(........)....))))
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- ((((....(....)........))))
- ((((..(.(....)..).....))))
- GGCAGACCAUACGGGAGAGAAACUUGCC
- 28
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- (((((.((....))..(.....))))))
- (((((......(....)......)))))
- (((((....(.(....).)....)))))
- (((((....(.(....))(...))))))
- GGAAGAGAUGGCGACUAAAACGACUUGUCGC
- 31
-
cAMP
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- GGCACGUGUAUUACCCUAGUGGUCGACGUGCC
- 32
-
Xanthine
- (((((((..(((((....)))))..)))))))
- ((((((((.(((((....)))))).)))))))
- GGUCUUACGUCGUUCGACUAUUGGGAGACC
- 30
-
L-Isoleucine
- ((((((..(((....)))......))))))
- ((((((.((((....)))....).))))))
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- UUACCACGCGCUCUUAACUGCUAGCGCCAUGGC
- 33
- ...(((.(((((..........)))))..))).
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- GGUGAAGGCAACGUAUAGGCAAGCACACUUCACC
- 34
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- AUGAUCAAUCGCCUCAAUUCGACAGGAGGCUCAC
- 34
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- UUGCUUGGAAUGCGUUAUAGUCUCUUAGGUGUGUA
- 35
-
SP6 RNA Polymerase
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- ..((((....................)))).....
- ..((((.....((......)).....)))).....
- CCGGUGCGCAUAACCACCUCAGUGCGAGCAAGGAA
- 35
-
Cyanocobalamin
- ......(((((..........))))).........
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- GGUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGU
- 37
-
E. Coli 5S RNA
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- Model Na+ Opt. Model
- UUCAACGCUGUGAAGGGCUUAUACGAGCGGAUUACCC
- 37
- ((((......))))((((((....)))).(....)))
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- ACGAAGCUUGAUCCCGUUUGCCGGUCGAUCGCUUCGA
- 37
- .((((((..(((((((.....)))..)))))))))).
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- GGAUCCCGACUGGCGAGAGCCAGGUAACGAAUGGAUCC
- 38
-
Malachite Green
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- ((((((((((((((....))))).)..))...))))))
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- AGUGAUACCAGCAUCGUCUUGAUGCCCUUGGCAGCACU
- 38
-
Theophylline
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- GGGUUGGGAAGAAACUGUGGCACUUCGGUGCCAUCAACCC
- 40
-
ATP
- (((((((..........((((((....)))))))))))))
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- GGCAUCGGAAAGUGGGUUGAUGUAAGUAACAGGCGAUGCC
- 40
-
L-Histidine
- (((((((....((....((.......))))...)))))))
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- GGAGACAUCCCUCUUGUUGGUGGUGCCGUGUGGAUGUCUC
- 40
-
HIV-1 Nucleocapsid
- .(((((((((.....((.......)).....)))))))))
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- GGAGGUGCUCCGAAAGGAACUCC
- 23
-
hlgG-Fc
- ((((....(((....))).))))
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- AGCCGCGAGGGGAGGGAUAGGGUAGGGCGCGGCU
- 34
- (((((((....(..........)....)))))))
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- GGGGGCUUAUCAUUCCAUUUAGUGUUAUGAUAACC
- 35
- ...((.(((((((..((.....))..)))))))))
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- CGAUGCGGUCUCAUGCGUCGAGUGUGAGUUUACCUUCG
- 38
- (((......(((((((.....))))))).......)))
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- (((.(.((((((((((.....)))))))...)))))))
- GCCUUAGUAACGUGCUUUGAUGUCGAUUCGACAGGAGGC
- 39
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- CGGCCACAGAAUGAAAAACCUCAUCGAUGUUGCAUAGUUG
- 40
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- GGCAGGUUUGGUAUUAACACGUUAAGUCGUGG
- 32
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- ACCCUGAUGGUAGACGCCGGGGUG
- 24
- ((((((.((.....)).)))))).
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- UGCCCUGCCCUCACCCGUUAGCCUGAGCGCCCCGCA
- 36
- ......((.((((..........)))).))......
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- GCGACUGGUUACCCGGUCGU
- 20
- GGUCUUACGUCGUUCGCGACUAUUGGGAGACC
- 32
-
L-Isoleucine
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- ((((((.(((((....))))....).))))))
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- UAUGGUAUGCUGUGUGGUAUGGGGUGGCGUGCUCU
- 35
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